北京协和医院妇产科内分泌组成立已近50年，最先在国内开展妇科内分泌的临床与基础研究，已制定和进行规范化的诊断和治疗。该中心进一步对患者施行人性化、配套化、整体化的服务模式，挂号、就诊、检查、取报告和诊断治疗均可在该中心完成。中心还为患者建立健康档案，提供终身的高效/价比的健康服务。
生殖内分泌主要诊治以下妇科内分泌疾病：
青春发育异常，如性早熟、青春发育延迟等；
各类月经失调，如功血、闭经、月经不规则等；
卵巢功能衰退及其相关疾病，如更年期综合征、卵巢早衰、生殖泌尿道萎缩性疾病、绝经后骨质疏松症等；
各种功能性和器质性不育，必要时推荐到东院生殖中心给予生殖辅助；
性发育异常相关疾病，如Turner综合征、雄激素不敏感综合征、生殖器畸形、先天性肾上腺皮质增生等；
其他妇科内分泌疾病，如高催乳素血症、多囊性卵巢综合征、内分泌有关的各类异常子宫出血和盆腔包块；
普通妇科疾病。
辅助生育中心建立于2001年，拥有世界领先的仪器设备和数名具有多年妇科内分泌临床经验并经国外长期专业培训的留学归国人员。目前可开展的辅助生育技术包括人工授精、体外授精－胚胎移植（试管婴儿）、卵细胞浆内单精子注射、冷冻胚胎移植、人工孵化等。
生殖内分泌秉承协和医院的严谨、求精、勤奋、奉献的优良传统，有完善的管理体制和规章制度，严格掌握各种助孕技术的适应证，根据每位不育患者的具体情况制定切实可行的治疗方案。近年来不论是新鲜周期移植还是胚胎复苏周期移植都取得了相当满意的妊娠率，处于国内领先地位。

分为东院和西院

东院地址：北京市东城区帅府园1号

西院地址：北京市西城区大木仓胡同41号